寶德推出科學(xué)計(jì)算HPC解決方案

　　寶德針對國內(nèi)科研院所的科學(xué)計(jì)算需求，推出了針對物理和化學(xué)計(jì)算的HPC解決方案。寶德技術(shù)專家分析，大部分物理化學(xué)軟件都是MPI并行程序，并行加速比較好，通�？梢詳U(kuò)展到32~128進(jìn)程以上，程序運(yùn)行方式通常是跨節(jié)點(diǎn)并行運(yùn)行;從并行算法分析，計(jì)算材料軟件的進(jìn)程間通信比較頻繁，屬于通信密集型應(yīng)用。因此，節(jié)點(diǎn)間網(wǎng)絡(luò)的延遲和帶寬對程序的并行加速比起著決定性的作用。使用傳統(tǒng)的千兆以太網(wǎng)很難發(fā)揮程序的并行性能，跨節(jié)點(diǎn)運(yùn)行時(shí)會導(dǎo)致嚴(yán)重的性能下降，成為整個(gè)計(jì)算過程的瓶頸。這樣推薦用戶使用高帶寬、低延遲的InfiniBand網(wǎng)絡(luò)。

　　寶德典型的物理化學(xué)計(jì)算集群系統(tǒng)包括登錄節(jié)點(diǎn)，計(jì)算節(jié)點(diǎn)，存儲節(jié)點(diǎn)和交換系統(tǒng)，并且具有優(yōu)異的性能和良好的擴(kuò)展性。計(jì)算節(jié)點(diǎn)選用寶德高密度服務(wù)器平臺，1U雙路多節(jié)點(diǎn)服務(wù)器PR1720H，滿足一般計(jì)算軟件和計(jì)算任務(wù)的需求;計(jì)算系統(tǒng)還可以根據(jù)需要配置幾臺四路或八路SMP胖節(jié)點(diǎn)，專為Gaussian等OpenMP并行程序或其它一些大內(nèi)存應(yīng)用配備。集群系統(tǒng)配置了兩臺寶德PR2510V服務(wù)器作為管理登錄節(jié)點(diǎn)，兩臺登錄管理節(jié)點(diǎn)配置雙機(jī)熱備，對作業(yè)調(diào)度、用戶管理等系統(tǒng)服務(wù)實(shí)現(xiàn)雙保險(xiǎn)，提高整個(gè)集群的高可用性。

　　計(jì)算網(wǎng)絡(luò)采用高帶寬、低延遲的QDR InfiniBand網(wǎng)絡(luò)，為并行程序提供無阻塞的通信高速通道;另外，配置一套或兩套千兆網(wǎng)絡(luò)，用于集群管理和監(jiān)控，千兆網(wǎng)絡(luò)也可作為備用計(jì)算網(wǎng)絡(luò)，提高系統(tǒng)的高可用性;存儲系統(tǒng)采用寶德GS-5120 FC/iSCSI-SAN磁盤陣列,提供了海量數(shù)據(jù)存儲能力的同時(shí)，其創(chuàng)新的RAID 級別提供了更高的數(shù)據(jù)保護(hù)功能。強(qiáng)大的硬件設(shè)計(jì)，靈活的擴(kuò)展操作和友好的管理界面，為客戶不同應(yīng)用提供簡單方便的解決方案。

　　本方案選擇了業(yè)界領(lǐng)先的寶德PR7010B刀片服務(wù)器，采用最新的處理器架構(gòu)，計(jì)算網(wǎng)絡(luò)使用40Gb的QDR Infiniband，非常適合計(jì)算物理、計(jì)算化學(xué)這樣的計(jì)算密集型和通信密集 型應(yīng)用;大容量、高性能、高容錯(cuò)、高可擴(kuò)展性的分布式并行存儲系統(tǒng)為集群提供了強(qiáng)大的存儲支持。冗余電源，熱插拔硬盤，高可靠的服務(wù)器存儲系統(tǒng)等設(shè)備和技術(shù)保證系統(tǒng)的可靠穩(wěn)定運(yùn)行;雙登錄管理節(jié)點(diǎn)、備用計(jì)算網(wǎng)絡(luò)、存儲系統(tǒng)的高容錯(cuò)技術(shù)為集群的提供了更高的可靠性。

　　寶德物理化學(xué)計(jì)算HPC解決方案不僅保障現(xiàn)有條件下的高性能計(jì)算，并且綠色節(jié)能，實(shí)現(xiàn)彈性部署。系統(tǒng)設(shè)計(jì)為用戶預(yù)留了自由的可擴(kuò)展空間，用戶可根據(jù)業(yè)務(wù)系統(tǒng)的增長，靈活地增配計(jì)算節(jié)點(diǎn)，擴(kuò)充計(jì)算網(wǎng)絡(luò)，提升計(jì)算性能;擴(kuò)充存儲系統(tǒng)的容量和性能，滿足增長的數(shù)據(jù)存放和IO性能需求。另外集群還引入寶德PDCM智能功耗控制系統(tǒng)能夠根據(jù)集群負(fù)載實(shí)時(shí)調(diào)整整個(gè)系統(tǒng)功耗，在不影響集群性能的情況下實(shí)現(xiàn)20%節(jié)能，真正實(shí)現(xiàn)綠色高效能計(jì)算。

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